:: ::
برگشت به فهرست مقالات برگشت به فهرست نسخه ها
خوشه‌بندی پروفایل‌های طولی با استفاده از مدل‌های اثرات آمیخته ناپارامتری و نیمه‌پارامتری
میثم تسلی زاده خمس، زهرا رضایی قهرودی
چکیده:   (3360 مشاهده)

مطالعات طولی یکی از شاخه­‌های علم آمار است که در ارتباط با مجموعه داده­هایی است که در طول زمان اندازه­­‌گیری می­شوند. یکی از حوزه­‌های مطالعاتی داده­های طولی در پزشکی و ژنتیک است. از آنجا که خوشه­بندی داده­های بیان ژن دوره­ای زمانی بافت­های سلولی افراد مختلف به خوشه­‌های همگن مفید است و کسب دانش از این مجموعه ­ی عظیم داده­‌ها ممکن است پیچیده و در مواردی غیر ممکن به­نظر آید، از این­رو شناسایی روش­‌هایی برای استخراج اطلاعات از این نوع داده‌­ها ضروری است. روش‌های متعددی برای خوشه­‌بندی داده­‌های بیان ژن دوره‌­ای زمانی وجود دارد ولی محدودیت­‌هایی برای این روش­ها وجود دارد که از جمله­‌ی آن­ها می­‌توان به عدم در نظر گرفتن همبستگی در طول زمان و زمان­بر بودن محاسبات اشاره داشت. در این مقاله با معرفی مدل­‌های اثرات آمیخته‌­ی ناپارامتری و نیمه‌­پارامتری، این همبستگی در طول زمان در نظر گرفته شده و با استفاده از اسپلاین تاوانیده حجم محاسبات به طور چشم‌­گیری کاهش یافته است. در پایان نیز با استفاده از مطالعه­‌ی شبیه­‌سازی به منظور بررسی عملکرد روش پیشنهادی، این روش با روش­‌های قبلی مقایسه می‌­شود و با استفاده از ملاک BIC مدل مناسب­تر در بین مدل­های معرفی شده انتخاب و تحلیل می‌­شود. همچنین روش پیشنهادی در یک مثال کاربردی داده­‌های بیان ژن دوره‌­ای زمانی ارائه شده است.

واژه‌های کلیدی: پروفایل‌های طولی، هموارسازی اسپلاین، اسپلاین تاوانیده، مدل اثرات آمیخته خطی، خوشه‌بندی مدل پایه، بیان ژن
متن کامل [PDF 7526 kb]   (885 دریافت)    
نوع مطالعه: كاربردي و توسعه ای | موضوع مقاله: آمار کاربردی
دریافت: ۱۳۹۴/۱/۱۴ | پذیرش: ۱۳۹۵/۱/۲۲ | انتشار: ۱۳۹۵/۹/۳۰



XML   English Abstract   Print


برگشت به فهرست مقالات برگشت به فهرست نسخه ها